Comment mesurer une tumeur cérébrale en tant que volume 3D?

Ils disent qu'ils peuvent combiner les images 2D dans leur esprit pour visualiser le volume 3D, mais ce n'est pas vrai.

Les méthodes actuelles de radiologie mesurent encore les tumeurs du cerveau et d'autres parties du corps en 2D. Cela vient de l'époque où les rayons X étaient affichés sur film. Avec l'invention des scanners IRM et CT est venue la possibilité de «visualiser» les tumeurs en 3D. Le problème est que la majorité des radiologues n'ont pas été formés pour utiliser un ordinateur pour visualiser des images en 3D. Ils ont été formés pour regarder des films. «Lire une image», c'est ce qu'ils disent. Ils disent qu'ils peuvent combiner les images 2D dans leur esprit pour visualiser le volume 3D, mais ce n'est pas vrai.

Pas

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Demandez à un chirurgien de demander un protocole «3d» pour l'IRM. Cela devient courant parce que les chirurgiens utilisent un logiciel de chirurgie guidée par image dans le bloc opératoire. Le protocole est des tranches de 1 mm, sans espacement, résolution 512x512, injection de contraste.
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Assurez-vous que le radtech comprend ce que vous voulez. Si vous n'obtenez pas de bonnes données, vous ne pouvez pas obtenir un volume 3D. Ce sera probablement un Axial 3D SPGR 1mm sans espacement si vous avez demandé au radtech de le faire. Il est préférable d'obtenir un scan 3D dans les trois plans, Axial, Sagital et Coronal.
- Le radiologue ne sait pas comment utiliser l'appareil ou le logiciel IRM, vous devez donc indiquer au RadTech ce que vous voulez. Le radiologue aime «reformater» un scan.
  - Cela ne donne pas de bonnes données 3D pour le séquençage. Vous pouvez également demander à ne scanner que la région de la tumeur. Il s'agit d'une nouvelle fonction sur les scanners GE et la plupart des Rad Techs savent quoi faire, mais les radiologues sont perdus parce que ce n'était pas une fonction qu'ils avaient à l'époque cinématographique. Ils ont l'habitude de regarder la tête entière, au lieu de simplement la région où se trouve la tumeur.
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Obtenez un CD des données dicom du radiologue. Cela devrait être la partie la plus facile, mais Radtech ne peut pas facturer cela et les filles du front office ne maîtrisent pas l'informatique, donc cela finit par être difficile. Ils sont tenus de le faire maintenant, alors insistez. Les radiologues sont très protecteurs de leurs données. La bonne chose, ce ne sont pas leurs données, ce sont les vôtres.
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Téléchargez le contenu du CD vers Dropbox ou Google Drive. L'avoir sur le cloud vous permettra d'y accéder depuis n'importe quel appareil.

Si vous n'obtenez pas de bonnes données, vous ne pouvez pas obtenir un volume 3D.
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Installez la version gratuite de la visionneuse DICOM "onis" sur PC. Ils n'ont pas encore de version MAC. La plupart des radiologues donnent une version gratuite d'un visualiseur sur le CD avec vos données. Celles-ci ne vous permettent pas "d'exporter" les images dicom dans un format lisible par le programme de séquençage 3D.
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Définissez les «chemins» dans ONIS vers l'emplacement de votre dossier de dépôt sur votre PC local.
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Double-cliquez sur la meilleure étude pour la 3D. Commencez par la série Axial 3D SPGR 1 mm 512x512. Faites défiler votre souris de haut en bas pour voir chaque image de la série. Vous pourriez avoir des centaines de tranches. Faites un clic droit sur l'image et sélectionnez "Exporter". Exportez toutes les images dicom dans un nouveau dossier nommé "Date de scan - Modalité - résolution" ou "2013,06.04 AX SPGR 1mm" Ceci est important car vous mesurerez probablement la tumeur au fil du temps.
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Cliquez sur OUVRIR et remplacez le nom du dossier créé par "2013,06
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Installez la version gratuite "itk-snap" 2,2. La dernière version 2,4 me donne des distorsions sur les vues Sagital et Coronal. Ceci est construit par l'Université de Pennsylvanie et fonctionne très bien.
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Cliquez sur fichier / charger à partir de l'image. Sélectionnez le dossier d'exportation Onis que vous avez créé.

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